MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 19000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006087	CCCAA	2	10	57	66	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_006087	CA	4	8	94	101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006087	AAT	2	6	120	125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006087	AC	3	6	1673	1678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006087	ATCC	2	8	1706	1713	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006087	TTA	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006087	GTC	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006087	GAG	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006087	CGC	2	6	1839	1844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_006087	TTG	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006087	GA	3	6	2002	2007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006087	TCGT	2	8	2049	2056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006087	CAG	2	6	2068	2073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006087	GA	3	6	3248	3253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006087	GTC	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006087	CG	3	6	5810	5815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006087	TGA	2	6	7918	7923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006087	CCA	2	6	11057	11062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_006087	CA	3	6	11146	11151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006087	GC	3	6	11165	11170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006087	ATG	2	6	11171	11176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006087	CTT	2	6	11184	11189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006087	ACC	2	6	11279	11284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_006087	CGGT	2	8	11321	11328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006087	G	6	6	11347	11352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006087	TG	3	6	11386	11391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006087	TGC	2	6	11500	11505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006087	GGT	2	6	11510	11515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006087	TCG	2	6	11529	11534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006087	ACC	2	6	11542	11547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_006087	GAC	2	6	11585	11590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006087	CGCC	2	8	11635	11642	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_006087	AGGC	2	8	11717	11724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006087	CAA	2	6	11821	11826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006087	CGA	2	6	11834	11839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006087	GGGT	2	8	11870	11877	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006087	TCCC	2	8	11885	11892	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_006087	GTCG	2	8	11949	11956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006087	TGAGCT	2	12	11970	11981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_006087	GCA	2	6	12039	12044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006087	GCG	2	6	12055	12060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006087	CGT	2	6	12070	12075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006087	CGT	2	6	12100	12105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006087	GC	3	6	12110	12115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006087	GCG	2	6	12226	12231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006087	GAT	2	6	12288	12293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006087	CAG	2	6	12335	12340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006087	ATC	2	6	12385	12390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006087	CAG	2	6	12432	12437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006087	CGT	2	6	12438	12443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006087	AGC	2	6	12455	12460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006087	CGCACT	2	12	12480	12491	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006087	TCG	2	6	12562	12567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006087	CGG	2	6	12698	12703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006087	CGCT	2	8	12845	12852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_006087	AGGG	2	8	13067	13074	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006087	GAA	2	6	13162	13167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006087	GTG	2	6	13277	13282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006087	TCT	2	6	13349	13354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006087	TA	3	6	13363	13368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006087	CCT	2	6	13420	13425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_006087	CAT	2	6	13476	13481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006087	CTTC	2	8	13550	13557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006087	GA	3	6	13570	13575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006087	TGG	2	6	13614	13619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006087	AGT	2	6	14522	14527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006087	CCG	2	6	14975	14980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_006087	CCT	2	6	15014	15019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_006087	GCGAG	2	10	15071	15080	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_006087	TTC	2	6	15082	15087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006087	CG	3	6	15505	15510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_006087	CCG	2	6	15519	15524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_006087	CG	3	6	15558	15563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006087	GCCT	2	8	15593	15600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006087	GAC	2	6	15648	15653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006087	CTC	2	6	15661	15666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_006087	CTT	2	6	15694	15699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006087	GA	3	6	15788	15793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006087	CGGAC	2	10	15796	15805	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_006087	TCC	2	6	15811	15816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_006087	TTA	2	6	17304	17309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006087	TTA	2	6	17349	17354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006087	CTGG	2	8	17413	17420	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_006087	CCGA	2	8	17859	17866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_006087	GCG	2	6	17882	17887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_006087	CG	3	6	17890	17895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_006087	CG	3	6	17901	17906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006087	CT	3	6	18683	18688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006087	GTTCTG	2	12	18721	18732	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_006087	TGG	2	6	18740	18745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006087	CGG	2	6	18746	18751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006087	CGG	2	6	21208	21213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006087	G	6	6	21261	21266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006087	CATG	2	8	28365	28372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_006087	GGCT	2	8	28406	28413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006087	GGGA	2	8	28435	28442	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006087	CG	3	6	28489	28494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_006087	C	6	6	28561	28566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_006087	ACGA	2	8	28573	28580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_006087	GAG	2	6	28593	28598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006087	GCCG	2	8	28665	28672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006087	CGATGA	2	12	28673	28684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_006087	TGC	2	6	28686	28691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006087	AG	3	6	28702	28707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006087	CG	3	6	28748	28753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006087	CGC	2	6	28767	28772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_006087	TG	3	6	28775	28780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006087	CG	3	6	29020	29025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_006087	GAG	2	6	29037	29042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006087	GAA	2	6	29411	29416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006087	TCGA	2	8	29517	29524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_006087	GC	3	6	29552	29557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_006087	GCCG	2	8	29564	29571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_006087	CCAA	2	8	29574	29581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006087	GTG	2	6	29631	29636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006087	CGG	2	6	29653	29658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006087	CG	3	6	29665	29670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006087	TG	3	6	29678	29683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006087	GAC	2	6	29688	29693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006087	CGT	2	6	29705	29710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006087	ACT	2	6	29731	29736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006087	GCG	2	6	29749	29754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006087	CGC	2	6	29759	29764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_006087	GCCG	2	8	29822	29829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_006087	ACG	2	6	29877	29882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006087	GCG	2	6	29913	29918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006087	CTG	2	6	29985	29990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006087	CCG	2	6	29992	29997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_006087	CTG	3	9	30009	30017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006087	TCG	2	6	30747	30752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006087	GA	4	8	30798	30805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006087	GCTC	2	8	30858	30865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006087	CAGCC	2	10	30871	30880	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_006087	ACT	2	6	30895	30900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006087	TCG	2	6	30911	30916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006087	CAA	2	6	30922	30927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006087	CCG	2	6	30938	30943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_006087	CCTT	2	8	30955	30962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_006087	GGC	2	6	30980	30985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006087	CGT	2	6	31003	31008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_006087	TAC	2	6	31059	31064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_006087	AGAACG	2	12	31093	31104	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_006087	GAG	2	6	31114	31119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006087	CAC	2	6	34038	34043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_006087	AG	3	6	34050	34055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006087	GGC	2	6	35163	35168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_006087	AC	3	6	35432	35437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_006087	G	6	6	35455	35460	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006087	GAG	2	6	35482	35487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_006087	CGA	2	6	64003	64008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_006087	CCT	2	6	64104	64109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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